1. Подпрограмма "Развитие лесного хозяйства Курганской области". Определяет цели, задачи и основные направления развития лесного хозяйства в сфере использования, охраны, защиты и воспроизводства лесов Курганской области, механизмы реализации мероприятий и показатели оценки их результативности. Направлена на формирование условий социально-экономического развития Курганской области в части обеспечения инновационного уровня использования, охраны, защиты и воспроизводства лесов при безусловном сохранении их глобальной экологической значимости.
2. "Развитие и использование минерально-сырьевой базы Курганской области".
Направлена на последовательное воспроизводство (развитие) минерально-сырьевой базы Курганской области путем проведения геолого-разведочных работ за счет различных источников финансирования, эффективное и рациональное использование минерально-сырьевой базы, на охрану недр. Содержит три направления: I - развитие минерально-сырьевой базы (геолого-разведочные работы); II - использование минерально-сырьевой базы; III - охрана недр.
3. Подпрограмма "Использование и охрана водных объектов Курганской области".
Направлена на прогнозирование развития негативных процессов на водных объектах Курганской области и осуществление мер по их охране, повышение защищенности населения и объектов экономики от наводнений и другого негативного воздействия вод за счет реализации комплексных мероприятий по приведению гидротехнических сооружений, находящихся в неудовлетворительном и опасном состоянии, к технически безопасному уровню, обеспечения населенных пунктов и объектов экономики сооружениями инженерной защиты.
4. Подпрограмма "Охрана и развитие государственных природных заказников Курганской области".
Мероприятия решают вопросы развития и поддержания на территории Курганской области сети государственных природных заказников регионального значения, в том числе сохранения и увеличения численности объектов животного мира, обитающих на территории заказников; обеспечения охраны объектов животного мира, государственного мониторинга охотничьих ресурсов и среды их обитания на территории заказников.
5. Подпрограмма "Охрана и воспроизводство объектов животного мира Курганской области".
Направлена на обеспечение рационального и эффективного использования объектов животного мира с целью удовлетворения текущих и перспективных потребностей экономики, воспроизводства и охраны окружающей среды, создания в этой сфере благоприятных условий для проживания населения Курганской области.
6. Подпрограмма "Охрана окружающей среды Курганской области".
Включает мероприятия по снижению негативного воздействия на окружающую среду, ликвидации объектов накопленного вреда окружающей среде, сохранению биологического разнообразия и развитию сети особо охраняемых природных территорий, развитию экологического просвещения, осуществлению государственного экологического надзора.
7. Подпрограмма "Обращение с отходами на территории Курганской области".
Включает мероприятия по созданию эффективной и безопасной системы обращения с отходами, в том числе с твердыми коммунальными отходами, экономическому стимулированию деятельности по сбору, обработке, утилизации и обезвреживанию отходов производства и потребления, предотвращению негативного воздействия отходов на компоненты окружающей среды, совершенствованию механизмов государственного управления в сфере обращения с отходами.
Содержание подпрограмм приведено в приложениях к государственной программе.