Городской округ "Город Южно-Сахалинск" - крупнейший транспортный узел острова Сахалин.
Транспортный каркас городского округа "Город Южно-Сахалинск" представляет собой систему транспортных коммуникаций, состоящую из подсистем улично-дорожной сети, железнодорожного транспорта, объекта воздушного транспорта - международного аэропорта "Южно-Сахалинск".
В настоящее время по территории городского округа город Южно-Сахалинск проходят неэлектрифицированные однопутные участки парк Южно-Сахалинск - Дальнее и Корсаков - Сокол Дальневосточной железной дороги - филиала ОАО "РЖД". В границах городского округа находятся железнодорожные станции Южно-Сахалинск Грузовой (на станции расположен вокзал), Христофоровка, Новоалександровка, а также остановочные пункты Луговое, Дальнее, Институт, Большая Елань, Октябрьский, Сити Молл, Хомутово, Березняки, Старорусское.
Подсистема воздушного транспорта представлена международным аэропортом "Хомутово", расположенном в южной части города и обслуживающим грузовые авиаперевозки и пассажирские связи с наиболее крупными городами материковой России.
По данным 2021 выполняются авиарейсы более чем по 20 направлениям (с учетом транзитных перевозок). По прямым маршрутам можно попасть в такие крупные российские города, как Москва, Хабаровск, Владивосток, Иркутск, Новосибирск и другие.
Регулярные прямые международные рейсы из Южно-Сахалинска выполняются в города Саппоро и Токио (Япония), Сеул (Республика Корея), Харбин (Китай).
В настоящее время АО "Аэропорт Южно-Сахалинск" находится в активной стадии инвестирования: ремонт взлетно-посадочных полос, обновление парка специальной техники и технологического оборудования, выполнение мероприятий по обеспечению информационной, транспортной, авиационной и пожарной безопасности, обеспечению соответствия аэропортов сертификационным требованиям.
Приказом Росавиации от 26.12.2019 N 1567-п "Об установлении приаэродромной территории аэродрома Южно-Сахалинск (Хомутово)" утвержден проект Решения об установлении приаэродромной территории.
В соответствии с Перечнем пунктов пропуска через государственную границу Российской Федерации, утвержденным распоряжением Правительства Российской Федерации от 29.11.2017 N 2665-р, на территории Сахалинской области действует воздушный грузопассажирский, постоянный, многосторонний пункт пропуска через Государственную границу Российской Федерации Южно-Сахалинск (Хомутово).
Подсистема внешней автомобильной сети представлена автомобильными дорогами федерального и регионального значения, связывающими город со всеми административными центрами муниципальных образований Сахалинской области, в том числе с городами: Холмск, Корсаков, Невельск, Поронайск, Оха, Углегорск. Принадлежность автомобильных дорог утверждена следующими документами: постановлением Правительства Российской Федерации от 17 ноября 2010 г. N 928 "О перечне автомобильных дорог общего пользования федерального значения" и постановлением Правительства Сахалинской области от 18.07.2013 N 355 (ред. от 11.11.2021 N 480) "Об утверждении Перечня и идентификационных номеров автомобильных дорог общего пользования регионального или межмуниципального значения Сахалинской области".
Внешние автомобильные связи городского округа находятся в удовлетворительном состоянии и имеют асфальтобетонное либо асфальтогравийное покрытие. Через паромную переправу Холмск - Ванино имеет выход на материковую сеть.
Подсистема внутригородской улично-дорожной сети представлена сетью магистральных улиц общегородского и районного значения, а также сетью местных улиц и внутриквартальных проездов.