Реализация Подпрограммы 3 осуществляется путем взаимодействия ответственного исполнителя по вопросам развития интеграции науки, инноваций и индустрии в Республике Тыва.
Государственным заказчиком Программы является Правительство Республики Тыва, ответственным исполнителем выступает Агентство по науке Республики Тыва.