5.1. В структуру Министерства входят:
5.1.1. управление по охране окружающей среды, реализации государственных программ и бухгалтерского учета.
Структура управления по охране окружающей среды, реализации государственных программ и бухгалтерского учета:
отдел экологии и биоразнообразия;
отдел реализации государственных программ;
отдел бухгалтерского учета и отчетности;
5.1.2. управление государственного контроля, правового и информационного обеспечения.
Структура управления государственного контроля, правового и информационного обеспечения:
отдел государственного контроля;
отдел организационно-правового обеспечения и кадровой работы;
отдел информационного обеспечения;
5.1.3. управление природопользования.
Структура управления природопользования:
отдел водных ресурсов;