2.1. Цели создания памятника природы "Бородинская пещера" - сохранение природного комплекса пещеры и ее компонентов от негативного воздействия антропогенных факторов, охрана объектов растительного и животного мира, в том числе занесенных в Красную книгу Российской Федерации и Красную книгу Республики Хакасия, популяризация и развитие рекреационного и туристического потенциала данной территории.
2.2. Основные задачи создания памятника природы "Бородинская пещера":
1) сохранение подземных ландшафтов и минеральных образований;
2) сохранение растительного и животного мира, в том числе редких видов растений и животных, занесенных в Красную книгу Российской Федерации и Красную книгу Республики Хакасия;
3) поддержание экологического баланса памятника природы "Бородинская пещера" в условиях его рекреационного и туристического использования;
4) экологическое воспитание, образование и просвещение населения.