5.1. Охрана памятника природы "Бородинская пещера" возлагается на Дирекцию и может осуществляться во взаимодействии с полицией, иными правоохранительными и контрольными (надзорными) органами, общественными инспекторами, общественными организациями и спецдружинами, а также иными организациями в установленном законодательством Российской Федерации и Республики Хакасия порядке.
5.2. Региональный государственный контроль (надзор) в области охраны и использования особо охраняемых природных территорий регионального значения на территории памятника природы "Бородинская пещера" осуществляется Дирекцией.