С учетом специфики отдельных секторов экономики определены следующие подпрограммы, объединяющие группы однотипных мероприятий программы:
- подпрограмма 1 "Энергосбережение и повышение энергетической эффективности в бюджетном секторе";
- подпрограмма 2 "Энергосбережение и повышение энергетической эффективности в жилищном фонде";
- подпрограмма 3 "Энергосбережение и повышение энергетической эффективности в транспортном комплексе";
- подпрограмма 4 "Рациональное использование топливно-энергетических ресурсов".