5.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность Главой Республики Саха (Якутия) по представлению Председателя Правительства Республики Саха (Якутия) и с согласия Государственного Собрания (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия).
5.2. Назначение на должность министра производится по согласованию с уполномоченным федеральным органом исполнительной власти по представлению Главы Республики Саха (Якутия).
5.3. Министр имеет заместителей (в том числе первых заместителей), назначаемых и освобождаемых от должности в установленном порядке.
5.4. Министр является главным государственным инспектором Республики Саха (Якутия) в области охраны окружающей среды.
5.5. Министр осуществляет руководство деятельностью Министерства на принципе единоначалия;
5.6. Министр, заместители министра в пределах своих компетенций несут ответственность за неисполнение или ненадлежащее исполнение своих должностных обязанностей в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Саха (Якутия).
5.7. В Министерстве образуется коллегия в составе министра (председатель), его заместителей, руководителей управлений, отделов и специалистов Министерства, руководителей федеральных органов исполнительной власти, исполнительных органов государственной власти Республики Саха (Якутия) в области охраны окружающей среды. Состав коллегии утверждается Правительством Республики Саха (Якутия).
5.8. В Министерстве создается Научно-технический совет (НТС) из ученых, высококвалифицированных специалистов, а также представителей научных, инженерных обществ и других организаций. Состав указанного Совета и Положение о нем утверждаются министром.
5.9. Министр:
(в ред. постановления Правительства РС(Я) от 17.04.2024 N 123)
1) распределяет обязанности между своими заместителями;
2) утверждает положения о структурных подразделениях Министерства, обеспечивает разработку учредительных документов подведомственных государственных учреждений;
3) решает в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) о государственной гражданской службе вопросы, связанные с прохождением государственной гражданской службы в Министерстве;
4) утверждает штатное расписание Министерства в пределах бюджетных ассигнований, фонда оплаты труда и численности работников с учетом реализации нормативных актов Главы Республики Саха (Якутия) и Правительства Республики Саха (Якутия);