Разливы реки Кондошки обладают высокой природоохранной и научной ценностью, а также имеют эколого-просветительское значение, являются основными нерестилищами и местами нагула молоди фитофильных видов рыб Рыбинского водохранилища.
Основными задачами ООПТ являются:
сохранение водных биологических ресурсов и среды их обитания;
сохранение основных нерестилищ и мест нагула молоди фитофильных и ценных видов рыб Рыбинского водохранилища;
обеспечение устойчивого пополнения промысловых запасов рыб Рыбинского водохранилища;
сохранение генетического фонда водных биологических ресурсов на территории ООПТ;
создание благоприятных условий для воспроизводства водных биологических ресурсов и обеспечение их устойчивого существования;
организация и осуществление эколого-просветительской деятельности и экологического туризма.