Протяженность, качество и структура транспортной системы являются основными составными элементами совокупного экономического потенциала региона.
Транспортное обслуживание населения и организаций на территории республики осуществляется автомобильным, железнодорожным и авиационным транспортом.
По состоянию на 1 января 2018 года транспортный комплекс республики включал 7468,57 км автомобильных дорог общего пользования, 666,9 км эксплуатационной длины железнодорожных путей общего пользования, 54,2 км троллейбусных линий, один аэропорт.
Республика Хакасия имеет развитую сеть автомобильных дорог общего пользования. Дорожная сеть состоит из автомобильных дорог общего пользования федерального, регионального, межмуниципального и местного значения.
По транспортным магистралям Хакасии перевозят руду, каменный уголь, промышленные грузы, строительные материалы и сырье, продовольственные товары.
По плотности автомобильных дорог общего пользования с твердым покрытием (37,82 км) республика занимает 5 место среди регионов СФО и 60 среди субъектов РФ, по удельному весу автомобильных дорог с усовершенствованным покрытием - 3 и 54 место соответственно.
Доля региональных и межмуниципальных автомобильных дорог, транспортно-эксплуатационное состояние которых соответствует нормативным требованиям, составила 69,0%.
В целях развития дорожной инфраструктуры в республике в 2022 - 2030 годах планируется реализация проекта "Строительство автомобильной дороги (транспортного коридора) Абакан - Бийск", позволяющего повысить интенсивность дорожного движения до 4000 автомобилей в сутки. Оцененная потребность в средствах ориентировочно составляет 47,2 млрд рублей, из них для строительства дороги по территории Хакасии - 9,4 млрд рублей.
Автомобильный транспорт. Пассажирские перевозки автомобильным транспортом являются самым массовым и доступным видом транспорта. В республике организовано 58 межмуниципальных междугородных маршрутов, 24 пригородных и 36 межрегиональных. Межрегиональные маршруты связывают Хакасию с Красноярским краем, Новосибирской, Томской, Кемеровской областями и Республикой Тыва. За период 2011 - 2017 годов деятельность по перевозке пассажиров автомобильным транспортом полностью перешла к предприятиям частной формы собственности. Уровень конкуренции на рынке транспортных услуг очень высокий. Если в 2011 году среди перевозчиков на предоставление права осуществления пассажирских перевозок автомобильным транспортом общего пользования по автобусным маршрутам регулярных перевозок, включая перевозку льготных категорий граждан, приняли участие 9 предпринимателей, то в 2016 году их было уже 28.
В 2017 году по сравнению с 2011 годом число перевезенных пассажиров автобусами индивидуальных предпринимателей возросло на 43,3% и составило 4278,7 тыс. человек.
По данным МВД России, ежегодно увеличивается количество автомобильного транспорта на территории региона. Наличие автомобильного транспорта в 2016 году в сравнении с 2012 годом увеличилось на 17,1%, за счет роста легкового автотранспорта - на 22,3%, при этом количество грузового автотранспорта и автобусов сократилось - на 16,9% и 13,3% соответственно.
Грузооборот предприятий автотранспорта за период 2011 - 2016 годов вырос на 9,5% и составил 393 млн т-км, при этом количество перевезенного груза сократилось на 56,3% (6,2 млн т).
Железнодорожный транспорт. Республика Хакасия - один из немногих субъектов Российской Федерации, в котором все административные районы и города имеют железнодорожное сообщение. Плотность железных дорог в 9,8 раза превышает показатель по Красноярскому краю. На рынке транспортных услуг одна из ведущих ролей отводится железнодорожному транспорту как в сфере грузовых, так и в сфере пассажирских перевозок. В общем грузообороте предприятий транспорта доля железнодорожного транспорта достигает 99%, в общем пассажирообороте - 45%. Суммарные объемы отправления и прибытия грузов по станциям ОАО "РЖД", расположенным на территории Республики Хакасия, в 2016 году составили 24,2 млн тонн, из них отправление грузов - 18,6 млн тонн, прибытие - 5,6 млн тонн. В течение ряда лет наблюдается снижение пассажироперевозок, в 2016 году перевезено на 307 тыс. пассажиров меньше, чем в 2010 году.
Железнодорожным сообщением охвачено 33 населенных пункта, эксплуатируются 43 железнодорожные станции, действуют 5 железнодорожных вокзалов в городах Абакане, Абазе, селах Шира, Аскиз и Бискамжа. Эксплуатационная длина железнодорожных путей в границах республики составляет 666,9 км. Большая часть железнодорожных путей оснащена устройствами диспетчерской централизации и автоблокировкой.