1. Департамент агропромышленного комплекса Костромской области.
2. Департамент государственного регулирования цен и тарифов Костромской области.
3. Департамент здравоохранения Костромской области.
4. Департамент имущественных и земельных отношений Костромской области.
5. Департамент информационной политики, анализа и развития коммуникационных ресурсов Костромской области.
6. Департамент культуры Костромской области.
7. Департамент лесного хозяйства Костромской области.
8. Департамент образования и науки Костромской области.
9. Департамент по труду и социальной защите населения Костромской области.
10. Департамент природных ресурсов и охраны окружающей среды Костромской области.
11. Департамент региональной безопасности Костромской области.
12. Департамент строительства, жилищно-коммунального хозяйства и топливно-энергетического комплекса Костромской области.
13. Департамент транспорта и дорожного хозяйства Костромской области.
14. Департамент финансов Костромской области.