Санитарное состояние лесов республики определяется комплексом природных и антропогенных факторов. Из природных явлений негативное влияние на состояние лесов оказывают засухи, морозы, ураганы и ливни.
Большое влияние на санитарное состояние лесов в последние годы оказывают возрастающее усиление рекреационной нагрузки, низкое освоение расчетной лесосеки, лесные пожары, массовое размножение вредных лесных насекомых и болезней леса.
В лесном фонде республики периодически происходят вспышки массового распространения вредителей хвойных и лиственных насаждений: непарного шелкопряда, дубовой зеленой листовертки, шелкопряда-монашенки, рыжего соснового пилильщика.
По данным лесопатологического мониторинга, с 2012 года началось увеличение численности и возникновение очагов елового обыкновенного пилильщика в еловых культурах.
Значительный ущерб лесному хозяйству в последние годы стал наносить жук короед-типограф. Площадь леса, пораженного очагами его распространения, составляет 1 887 гектаров.