Координацию работы и контроль за реализацией Концепции осуществляет Департамент поддержки и развития малого предпринимательства города Москвы и другие органы исполнительной власти города Москвы, уполномоченные на проведение контроля.
Контроль за целевым использованием средств осуществляет Департамент поддержки и развития малого предпринимательства города Москвы.
Отбор исполнителей программных мероприятий производится на конкурсной основе в соответствии с законодательством о размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд.