Управление Программой осуществляется Комитетом физической культуры и спорта города Москвы и Департаментом образования города Москвы. Управление осуществляется путем подготовки и непосредственного осуществления предусмотренных Программой мероприятий. Отбор исполнителей программных мероприятий проводится на конкурсной основе в соответствии с действующим законодательством. Отчетность по мероприятиям предоставляется исполнителями поквартально.
Эффективность Программы оценивается через индикаторные показатели на основании мониторинга выполнения Программы. Основные мероприятия по мониторингу предусмотрены в соответствующем разделе Программы.
На основании оценки эффективности реализация Программы принимаются ежегодные решения о корректировке финансирования отдельных мероприятий Программы, исключение неэффективных, добавление новых, с целью безусловного достижения обозначенных в Программе конечных результатов.
Отчеты по Программе предоставляются в Департамент экономической политики и развития города Москвы до 1 марта - отчет о выполнении программы за отчетный год и до 15 ноября - отчеты о фактическом выполнении программы за 9 месяцев и об ожидаемом выполнении за текущий год.