5.1. Контроль и координация деятельности экспериментального Центра в целом осуществляется префектурой Зеленоградского административного округа города Москвы.
5.2. Функции координации, методической поддержки и контроля за проведением эксперимента на территории Зеленоградского административного округа города Москвы осуществляются Управлением по координации и развитию административной реформы Правительства Москвы и Департаментом территориальных органов исполнительной власти города Москвы, а также Временной рабочей группой, созданной соответствующим приказом руководителя Аппарата Мэра и Правительства Москвы от 1 декабря 2006 года N 698-КПР.
5.3. Координацию и контроль деятельности Центра в рамках оперативного и текущего управления осуществляет начальник ЕИРЦ Зеленоградского административного округа города Москвы.