Для управления реализацией Программы Правительством Москвы может быть создана Рабочая группа (или Дирекция) при государственном заказчике Программы - Департаменте жилищно-коммунального хозяйства и благоустройства города Москвы.
Функции технического сопровождения и контроля Программы могут быть поручены ГУ ЦОДД.
Функции финансового контроля осуществляются государственным заказчиком в установленном порядке.
Координация действий органов городских комплексов, участвующих в реализации Программы, осуществляется Рабочей группой (Дирекцией).