Основной рекой бассейна является Сходня. Нижнее течение р.Сходни проходит по территории Москвы. Среднее течение проходит по территории области, частично примыкая к новым районам города - Куркино. В верхнем течении р.Сходни расположен г.Зеленоград.
Вблизи устья в р.Сходню впадает отводящий канал Сходненской ГЭС, расход которого в 20 раз превышает меженный расход самой реки. Через Сходненскую ГЭС сбрасывается в Сходню и затем в р.Москву обводнительный расход воды из Волги. По территории бассейнового региона "Сходня" проходит также судоходный канал со шлюзами, связывающий Химкинское водохранилище и р.Москву. К бассейновому региону "Сходня" для удобства рассмотрения отнесены также р.Химка и р.Чернушка, впадающие в р.Москву вблизи нижнего конца судоходного канала, а также (условно), расположенная в пределах города часть территории Ново-Подрезково, относящейся к бассейну р.Клязьмы.
В регионе находится 28 прудов, расположенных в бассейнах и руслах рек Сходни, Чернушки и притоков р.Клязьмы.
Река Сходня в истоке в р-не Алабушево сильно загрязнена. Однако, на участке от Зеленограда до МКАД ее загрязненность незначительна. Здесь специальных мероприятий для дополнительной очистки стока не требуется.
У границ Москвы загрязненность воды нефтепродуктами последовательно возрастает. В устьевом участке концентрация нефтепродуктов - 0,19 мг/л, ВПК - 2,5 мг/л, что ниже, чем ПДК для водоемов культурно-бытового использования. Однако значительно превышают установленные ПДК содержание меди (0,13 мг/л) и цинка (0,16 мг/л).
Качество воды в устье р.Сходни в значительной степени определяет загрязненность воды в р.Москве в черте города. Причем качество воды в устье р.Сходни на 4/5 определяется качеством воды, сбрасываемой из Химкинского водохранилища через ГЭС. Поэтому нужны меры по максимальному снижению загрязненности воды, поступающей в р.Москву с целью хотя бы частичной компенсации неизбежного последующего загрязнения воды. В этих целях требуются специальные мероприятия по снижению загрязнения вод, поступающих в р.Сходню из Химкинского водохранилища, которыми могут являться очистные сооружения в подводящем и отводящем каналах ГЭС.
Повышенное содержание тяжелых металлов в р.Сходне требует усиления инспекционной работы по поиску загрязненных сбросных вод и их ликвидации.
Кроме того, предусмотрено полное природоприближенное восстановление рек в черте города и достаточное количество очистных сооружений на водовыпусках из коллекторной сети в реки и ручьи.
На территории г.Зеленограда предусмотрена полная природоприближенная реконструкция рек Сходни и Ржавки, причем для последней предусмотрено открытие 400 м канализованного русла на территории парка "Ровесник". Для рек Горетовки, Каменки и Крюковки предполагается частичная реконструкция на участках, требующих этого. Предусматривается также реконструкция 9 прудов (средства на реконструкцию 3 из них предусмотрены другими городскими документами).