Общий объем затрат на выполнение Программы составляет 3153 млн.рублей на период 2005-2009 годы.
Основным источником финансирования являются целевые ассигнования из бюджета города Москвы.
Финансовое обеспечение проведения научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ (раздел 5.4) осуществляется через Департамент науки и промышленной политики города Москвы.
В срок до 1 сентября 2004 года Департаментом топливно-энергетического хозяйства города Москвы будут представлены предложения по привлечению финансовых средств сторонних инвесторов.