5.1. Департамент возглавляет руководитель, назначаемый и освобождаемый от должности Правительством Москвы.
5.2. Руководитель Департамента имеет заместителей, назначаемых Правительством Москвы. Распределение обязанностей между ними производится руководителем Департамента.
5.3. В Департаменте образуется коллегия, в составе руководителя (председатель коллегии), его заместителей, являющихся членами коллегии по должности, руководящих работников Департамента, руководителей территориальных органов управления здравоохранением, а также представителей общественных и профессиональных объединений медицинских и фармацевтических работников, других организаций, участвующих в обеспечении охраны здоровья населения. Состав коллегии и положение о ней утверждаются приказом руководителя Департамента.
5.4. Руководитель Департамента:
5.4.1. Руководит деятельностью Департамента, несет персональную ответственность перед Правительством Москвы за выполнение возложенных на Департамент задач.
5.4.2. Подписывает в пределах своей компетенции приказы, распоряжения и другие нормативные акты, обязательные для исполнения всеми должностными лицами учреждений, предприятий и организаций, входящих в систему городского здравоохранения, а по отдельным вопросам в установленных случаях - должностными лицами учреждений, предприятий и организаций здравоохранения независимо от ведомственной подчиненности и организационно-правового статуса (пункт в редакции, введенной в действие со 2 февраля 2010 года постановлением Правительства Москвы от 19 января 2010 года N 30-ПП, - см. предыдущую редакцию).
5.4.3. Распоряжается финансовыми средствами и имуществом Департамента в установленном порядке.
5.4.4. В пределах утвержденного фонда оплаты труда утверждает положение о материальном стимулировании государственных служащих Департамента и вносит в него необходимые изменения. Решает вопросы премирования и поощрения государственных служащих Департамента.
5.4.5. Назначает, освобождает, поощряет и наказывает в дисциплинарном порядке государственных служащих Департамента, руководителей территориальных органов управления здравоохранением, учреждений, предприятий и организаций, входящих в основную номенклатуру должностей Департамента, в соответствии с действующим законодательством.
5.4.6. Утверждает положения о структурных подразделениях Департамента.
5.4.7. Представляет без доверенности Департамент в государственных, городских, общественных и иных организациях, ведомствах и учреждениях, в том числе зарубежных и международных, по вопросам, входящим в компетенцию Департамента.
5.4.8. Участвует в установленном порядке в утверждении положений и уставов государственных учреждений, организаций и предприятий здравоохранения и фармацевтического обеспечения.
5.4.9. Утверждает структуру и штатное расписание Департамента и его территориальных органов управления здравоохранением, оклады и надбавки государственных служащих Департамента и его территориальных органов управления здравоохранением.
5.4.10. По согласованию с префектами административных округов назначает на должность и освобождает от должности начальников территориальных органов управления здравоохранением административных округов.