Основной контроль за выполнением Программы осуществляет комитет общего и профессионального образования Ленинградской области.
Текущий контроль осуществляют органы местного самоуправления и комитет по экономике и инвестициям Ленинградской области.
Результаты контроля представляются в комитет по экономике и инвестициям Правительства Ленинградской области ежеквартально.
Общий контроль осуществляет вице-губернатор Ленинградской области Н.И.Пустотин.