Целями деятельности Совета являются:
2.1. Обеспечение государственно-общественного характера управления выполнением городской программы "Здоровье детей" на 2003-2005 годы.
2.2. Содействие координации деятельности медицинских, образовательных учреждений, учреждений социальной защиты населения и спорта.
2.3. Взаимодействие с федеральными медицинскими и образовательными учреждениями.
2.4. Определение приоритетов в мероприятиях по сохранению здоровья детей Москвы.
2.5. Участие в разработке рекомендаций и предложений по реформированию и развитию системы здравоохранения и образования, направленных на укрепление здоровья детей.
2.6. Участие в создании и экспертизе нормативных правовых актов в области охраны здоровья детей.
2.7. Подготовка предложений по проблемным вопросам здоровья детей Москвы для их решения в органах законодательной и исполнительной власти города.
2.8. Координация деятельности городских служб, организаций и учреждений по развитию здравоохранения и образования в Москве.
2.9. Координация деятельности организаций и учреждений по обеспечению качественного оказания медицинской помощи детям.