Контроль за деятельностью Департамента осуществляет Правительство Москвы и заместитель Премьера Правительства Москвы по внешним связям.
Проверка деятельности Департамента осуществляется в установленном законом порядке уполномоченными Правительством Москвы органами и организациями, которым это право предоставлено в соответствии с действующим законодательством.