Основными задачами КЧС являются:
разработка предложений руководству ведомства по развитию, совершенствованию и повышению эффективности управления деятельностью ведомственной подсистемы МГСЧС, обеспечению постоянной готовности ее органов управления, сил и средств к действиям в ЧС;
организация разработки и осуществление мероприятий по предупреждению возникновения ЧС в организациях подсистемы;
проведение мероприятий по уменьшению тяжести последствий и руководство работами по ликвидации ЧС в организациях подсистемы;
участие в разработке и осуществлении городских, межрегиональных и федеральных целевых и комплексных научно-технических программ по проблемам предупреждения и ликвидации ЧС в интересах отрасли, города;
руководство созданием сил и средств подсистемы, чрезвычайных резервных фондов финансовых и материально-технических ресурсов;
организация постоянного наблюдения и контроля за состоянием потенциально опасных объектов ведомства, оценки и прогнозирования возможности возникновения ЧС и их последствий;
организация подготовки персонала к действиям в ЧС;
координация деятельности КЧС, входящих в подсистему организаций, независимо от форм их собственности, оказание помощи в выполнении возложенных на них задач;
организация взаимодействия с КЧС Правительства Москвы, других ведомственных подсистем, Главным управлением ГОЧС г.Москвы, общественными организациями по вопросам сбора и обмена информацией о ЧС, а в случае необходимости - оказания взаимной помощи в их ликвидации;
участие в разработке предложений по проведению научных исследований в области защиты от ЧС природного и техногенного характера; по решению проблем безопасности в Москве;
руководство действиями сил подсистемы при угрозе возникновения, возникновении ЧС и в период ликвидации их последствий;
организация расследования причин аварий, приводящих к возникновению ЧС, и определение нанесенного отрасли материального ущерба;
организация контроля за выполнением подчиненными органами управления и организациями решений, принятых вышестоящими органами и Правительством Москвы, а также требований руководящих документов в области защиты от ЧС.