5.1. РЭК г.Москвы возглавляет председатель, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Мэром Москвы по согласованию с Федеральной энергетической комиссии Российской Федерации.
5.2. Первый заместитель и заместители председателя РЭК г.Москвы назначаются на должность и освобождаются от должности Премьером Правительства Москвы по представлению председателя РЭК г.Москвы.
5.3. Для определения основных направлений деятельности РЭК г.Москвы и принятия решений из числа высококвалифицированных специалистов, работающих в комиссии, образуется правление в количестве не более 7 человек, включая председателя. Персональный состав правления определяется Премьером Правительства Москвы по представлению председателя РЭК г.Москвы.
5.4. Члены РЭК г.Москвы и сотрудники ее аппарата, исполняющие свои обязанности на профессиональной постоянной основе, являются государственными служащими города Москвы.
5.5. При РЭК г.Москвы действует экспертный совет из представителей органов государственной власти, органов местного самоуправления, ученых, специалистов.
5.6. Председатель РЭК г.Москвы:
5.6.1. Осуществляет общее руководство деятельностью комиссии.
5.6.2. Утверждает штатное расписание комиссии в пределах установленной численности и фонда оплаты труда.
5.6.3. Назначает на должность и освобождает от должности работников аппарата комиссии.
5.6.4. Определяет должностные обязанности своих заместителей, членов комиссии и работников аппарата комиссии.
5.6.5. В пределах выделенных из бюджета города средств на содержание РЭК г.Москвы утверждает и вносит изменения в структуру комиссии, штатное расписание и должностные оклады работников аппарата, включая установление им надбавок к должностным окладам, в смету расходов и в положение о материальном поощрении работников РЭК г.Москвы, решает вопросы повышения квалификации кадров.
5.6.6. Осуществляет мероприятия по улучшению условий труда, отдыха и быта сотрудников комиссии.
5.6.7. Устанавливает правила внутреннего трудового распорядка, принимает меры по поддержанию и соблюдению исполнительской и трудовой дисциплины в РЭК г.Москвы.
5.6.8. Представляет РЭК г.Москвы в федеральных, городских, общественных и иных учреждениях, предприятиях и организациях, в том числе зарубежных, по вопросам, входящим в ее компетенцию.
5.6.9. Несет персональную ответственность за выполнение возложенных на РЭК г.Москвы задач и осуществление ею своих функций.