Департамент имеет право:
5.1. Вносить на рассмотрение Мэра Москвы, Вице-мэра Москвы, Правительства Москвы, Премьера Правительства Москвы и его заместителей предложения по вопросам, входящим в компетенцию Департамента.
5.2. Запрашивать и получать в установленном порядке от органов исполнительной власти города Москвы, контрольных и надзорных органов, организаций любых форм собственности, расположенных на территории города, информацию, необходимую для выполнения Департаментом возложенных на него функций.
5.3. Разрабатывать предложения к планам и программам, принимаемым федеральными органами государственной власти и затрагивающим интересы Москвы как субъекта Российской Федерации в части, относящейся к компетенции Департамента.
5.4. Осуществлять в установленном порядке и в пределах своей компетенции функции главного распорядителя и получателя бюджетных средств города Москвы.
5.5. Рассматривать и согласовывать представляемые организациями науки и промышленности государственной или иной (с долей государства более 25%) форм собственности предложения по вопросам продажи имущества, сдачи его в аренду, передачи имущества в залог или в качестве вклада в уставный капитал других хозяйственных обществ или товариществ.
5.6. Участвовать в пределах своей компетенции и в рамках законодательства в проверках финансово-хозяйственной деятельности организаций науки и промышленности города, соблюдения ими законов, норм, правил и лицензий.
Осуществляет контроль в пределах своей компетенции за соблюдением федерального законодательства и законодательства города Москвы.
5.7. По поручению Мэра Москвы, Вице-мэра Москвы, Правительства Москвы, Премьера Правительства Москвы и его заместителей проводить переговоры, заключать договоры и соглашения в пределах своей компетенции.
5.8. Привлекать на договорной основе научно-исследовательские, проектно-конструкторские организации, высшие учебные и другие учреждения, а также отдельных специалистов и экспертов, включая зарубежных, для разработки наиболее важных и сложных вопросов развития и совершенствования управления организациями науки и промышленности, а также для подготовки предложений к проектам программ, прогнозов и других разработок, относящихся к сфере деятельности Департамента.
5.9. Определять условия приемки и оплаты проектных, научно-исследовательских, опытно-конструкторских и иных работ, финансируемых за счет средств бюджета города Москвы. Участвовать в приемке научно-технических разработок, исследований и проектов, обеспечивая при необходимости их независимую экспертизу.
5.10. Формировать предложения по развитию организаций науки и промышленности, действующих в приоритетных направлениях или выполняющих городской заказ, для включения их в городские и федеральные (от имени города) целевые программы, финансируемые из бюджета города и федерального бюджета.
5.11. Организовывать совместно с иными органами городской администрации оптовые торговые ярмарки с целью формирования оптового рынка товаров и услуг, предоставляемых московской промышленностью.
5.12. Участвовать совместно с Управлением городского заказа в формировании городского заказа для обеспечения нужд комплекса социальной сферы города Москвы.
5.13. Участвовать совместно с Комитетом труда и занятости в направлении средств Фонда занятости на поддержку московских организаций науки и промышленности, выпускающих конкурентоспособную продукцию, с целью создания новых или сохранения имеющихся рабочих мест.
5.14. Представлять в установленном порядке интересы города Москвы в судах, иных органах государственной власти и организациях по вопросам ведения Департамента.
5.15. Вносить предложения о создании, реорганизации, ликвидации государственных (муниципальных) унитарных предприятий, учреждений, об участии города в хозяйственных обществах, по поручению Правительства Москвы назначать и освобождать от должности руководителей предприятий, учреждений, заключать с ним контракты и осуществлять иные действия в соответствии правовыми актами города Москвы.