3.1. Комитет возглавляет председатель, который по должности является заместителем главы администрации Москвы.
3.2. Председатель Комитета назначается на должность председателем Госкомимущества России по представлению главы администрации Москвы в соответствии с действующим законодательством.
Освобождение председателя Комитета от занимаемой должности осуществляется председателем Госкомимущества России в соответствии с действующим законодательством.
3.3. Председатель несет всю полноту ответственности за деятельность Комитета.
3.4. Председатель осуществляет руководство Комитетом на основе единоначалия:
- действует без доверенности от имени Комитета, представляет его во всех учреждениях и организациях;
- издает приказы, обязательные для исполнения всеми государственными предприятиями, учреждениями, организациями и органами государственного управления, а также распоряжения по имущественным вопросам в пределах компетенции Комитета;
- издает приказы и распоряжения во исполнение распоряжений Госкомимущества России, главы администрации Москвы и постановлений правительства Москвы;
- определяет компетенцию своих заместителей;
- назначает и освобождает от должности в соответствии с трудовым законодательством Российской Федерации работников Комитета и его подразделений;
- определяет структуру и штатное расписание в пределах утвержденной Госкомимуществом России сметы;
- утверждает положения о структурных подразделениях Комитета;
- распоряжается в соответствии с действующим законодательством имуществом и средствами, закрепленными за Комитетом;
- осуществляет контроль за действиями подчиненных ему подразделений, утверждает должностные инструкции руководителей подразделений и служб Комитета;
- применяет к работникам Комитета меры поощрения, налагает на них взыскания в соответствии с действующим законодательством;
- открывает и закрывает в банках расчетные и иные счета, совершает по ним операции, подписывает финансовые документы;
- обеспечивает соблюдение финансовой и учетной дисциплины.
3.5. В каждом административном округе г.Москвы Комитет создает территориальное агентство, имеющее статус филиала:
Центральное территориальное агентство;
Северное территориальное агентство;
Северо-Восточное территориальное агентство;
Восточное территориальное агентство;
Юго-Восточное территориальное агентство;
Южное территориальное агентство;
Юго-Западное территориальное агентство;
Западное территориальное агентство;
Северо-Западное территориальное агентство;
Зеленоградское территориальное агентство."