Основными задачами и функциями Рабочей группы являются:
1. Координация работ по подготовке документов о правовом статусе реки Москвы и созданию нормативно-правовой базы о закреплении акваторий реки Москвы, ее притоков, водохранилищ, затонов, рейдов, расположенных в черте города.
2. Подготовка предложений по заключению договоров на долгосрочное пользование водными объектами.
3. Контроль за качеством воды в реках Москва, Яуза в административных границах города.
4. Контроль за строительством и реконструкцией водохозяйственных и иных объектов, расположенных в акваториях рек Москвы, Яузы, Химкинском водохранилище и на прилегающих территориях в административных границах города.
5. Контроль за техническим состоянием гидротехнических и иных сооружений, расположенных в акваториях рек Москвы, Яузы, Химкинском водохранилище и на прилегающих территориях.
6. Подготовка предложений по механизму экономического стимулирования предприятий и организаций, имеющих объекты и сооружения на акваториях и территориях, прилегающих к реке Москве, ее притокам и водохранилищам, направленного на соблюдение водоохранного законодательства, санитарных норм и правил.
7. Внесение предложений в Правительство Москвы по улучшению содержания акваторий рек Москвы, Яузы и прилегающих территорий.
8. Определение зон контроля и ответственности учреждений, предприятий и организаций для закрепления части акваторий рек Москвы, Яузы, инженерных сооружений и территорий в границах земель водного фонда.
9. Координация выполнения научно-исследовательских и экспериментальных работ, направленных на улучшение содержания акватории реки Москвы, ее притоков, водохранилищ и прилегающих территорий в черте города.
10. Подготовка проектов нормативных актов, в том числе закона (законов) города Москвы о регулировании водных отношений в соответствии с компетенцией Москвы как субъекта Российской Федерации.