Споры между Московской городской Думой и Московской городской администрацией, возникающие по вопросам их компетенции, которые не нашли своего разрешения путем осуществления согласительных процедур, разрешаются Конституционным судом Российской Федерации в соответствии со статьей 125 Конституции Российской Федерации.
Споры между Думой и мэром, возникающие по вопросам принятия законодательных актов города Москвы, решаются путем создания на паритетной основе согласительных комиссий на срок не более двух месяцев. При отсутствии согласия по истечении установленного срока рассмотрение спора может быть передано в Московский городской суд.