4.1. Руководство деятельностью Мосэкофонда осуществляет правление.
4.1.1. Состав правления Мосэкофонда утверждается постановлением правительства Москвы и решением президиума Моссовета.
4.1.2. В состав правления входят три представителя Моссовета, три представителя правительства Москвы, три представителя Москомприроды и по одному представителю от Московского городского центра санитарно-эпидемиологического надзора, Московского центра гидрометеорологии и наблюдения окружающей среды и Московской городской вневедомственной экспертизы.
4.1.3. Председателем правления является председатель Московского городского комитета по охране природы.
4.1.4. Состав правления и кандидатура председателя правления утверждаются на срок полномочий Моссовета очередного созыва.
4.1.5. В случае признания правительством Москвы и Моссоветом работы правления неудовлетворительной его состав может быть изменен ранее окончания установленного срока деятельности правления.
4.2. К компетенции правления Мосэкофонда относятся следующие полномочия:
4.2.1. Утверждение положений о территориальных и целевых отделениях Мосэкофонда, составов их правлений, кандидатур председателей правлений и распорядителей средств; утверждение положений о филиалах и иных обособленных подразделениях фонда;
4.2.2. Утверждение структуры, штатного расписания и сметы расходов на содержание исполнительной дирекции, а также Положения об исполнительной дирекции;
4.2.3. Утверждение бюджета Мосэкофонда, финансовых отчетов и смет расходования средств Центрального отделения;
4.2.4. Утверждение отчетных финансовых документов по поступлению и расходованию средств территориальных и целевых отделений Мосэкофонда;
4.2.5. Представление бюджета Мосэкофонда, сметы финансирования программ, годовых отчетов и сметы использования средств, структуры инвестиций для утверждения Моссоветом;
4.2.6. Принятие решений по финансированию реализации экологических программ, проектов, научно - исследовательских разработок, других мероприятий в соответствии с утвержденными направлениями расходования средств Мосэкофонда;
4.2.7. Принятие решений по выделению средств Мосэкофонда на предупреждение (ликвидацию) последствий аварий, катастроф, стихийных бедствий;
4.2.8. Рассмотрение предложений об изменении и дополнении Положения о Московском городском экологическом фонде;
4.2.9. По решению правления им могут быть рассмотрены иные вопросы деятельности Мосэкофонда;
4.2.10. Правление Мосэкофонда является одновременно правлением Центрального отделения Мосэкофонда;
4.3. Для осуществления руководства текущей деятельностью Мосэкофонда правление создает исполнительную дирекцию во главе с исполнительным директором, назначаемым правлением Мосэкофонда.
Компетенция исполнительной дирекции Мосэкофонда определяется положением, утверждаемым правлением Мосэкофонда.
4.4. Финансирование аппарата Мосэкофонда,включая его центральное, территориальные и целевые отделения, и стимулирование деятельности природоохранных организаций осуществляются по смете расходов, утверждаемой правлением Мосэкофонда в пределах 5% суммы средств, поступивших за истекший период на счета (субсчета) соответствующих отделений.
4.5. Исполнительная дирекция Мосэкофонда одновременно является дирекцией Центрального отделения Мосэкофонда.
4.6. Решения правления в рамках его полномочий и компетенции являются обязательными к исполнению исполнительной дирекцией Мосэкофонда и всеми его отделениями и подразделениями.
Решения правления Мосэкофонда могут быть приостановлены на срок до одного месяца председателем правления Мосэкофонда и отменены правительством Москвы и Моссоветом.
4.7. Распорядители целевых и территориальных отделений Мосэкофонда отчитываются о своей деятельности по итогам полугодий перед дирекцией Центрального отделения Мосэкофонда.
4.8. Контроль за финансовой деятельностью Мосэкофонда осуществляет ревизионная комиссия, образуемая из представителей (по одному человеку) Моссовета, администрации Москвы и Москомприроды.
4.9. Правление Мосэкофонда осуществляет свою работу в форме заседаний на регулярной основе, но не реже 1 раза в месяц. Правление Мосэкофонда правомочно принимать решения при наличии не менее 2/3 его численного состава. Решения принимаются большинством голосов присутствующих на заседании членов правления. Дата заседания правления и повестка дня определяются председателем правления.