2.1. Формирование и проведение скоординированной с федеральными органами исполнительной власти научной и промышленной политики Правительства Москвы, включая определение приоритетных направлений деятельности и развития науки и промышленности города, а также выбор направлений структурных и институциональных преобразований предприятий науки и промышленности.
2.2. Эффективное использование научно-технического потенциала, увеличение вклада науки и техники в развитие экономики города, с целью реализации важнейших социальных задач.
2.3. Проведение инвестиционной политики научно-промышленного комплекса и мобилизация трудовых, финансовых и других ресурсов для выполнения принятых Правительством Москвы инвестиционных и инновационных программ и проектов.
2.4. Повышение эффективности использования государственной собственности предприятий науки и промышленности на основе приватизации, организации корпоративного и доверительного управления ею, реорганизации и санации несостоятельных предприятий.
2.5. Участие в формировании и размещении на предприятиях науки и промышленности, находящихся на территории г.Москвы, городского заказа для обеспечения нужд населения города и общегородских нужд.
2.6. Подготовка для внесения в установленном порядке в законодательные органы власти города и Российской Федерации предложений по разработке и изменению действующего законодательства по вопросам компетенции Департамента.
2.7. Организация, в рамках компетенции Департамента, исполнения законодательных и иных нормативных актов Российской Федерации в области обороны.