Бюджет Совета, включая и его инвалютную часть, формируется за счет взносов, вносимых правительствами государств-участников Таможенного союза по согласованным между ними квотам, как это предусмотрено статьей 7 Соглашения о принципах таможенной политики государств-участников Содружества.
Бюджетный год Совета начинается 1 января и завершается 31 декабря календарного года.
Государства-участники Таможенного союза выплачивают свои полные бюджетные взносы не позднее 1 февраля наступившего бюджетного года.