Ведение Реестра включает его составление, хранение, систематизацию и защиту содержащейся в Реестре информации, а также актуализацию Реестра, представляющую собой отражение в Реестре возникновения и прекращения прав на имущество Санкт-Петербурга, изменения сведений об имуществе Санкт-Петербурга, указываемых в Реестре.
Ведение Реестра осуществляется на бумажных носителях информации, представляющих собой учетные дела на каждый объект учета имущества Санкт-Петербурга, и в электронном виде посредством государственных информационных систем Санкт-Петербурга.