Методы in vitro часто используют для определения потенциала химических веществ индуцировать генотоксичность. Применяют несколько методов, так как один выбранный метод не может обнаружить все известные генотоксиканты. Генотоксиканты часто приводят к различным эффектам (например, к крупным хромосомным перестройкам по сравнению с небольшими повреждениями, или к точковым мутациям, или к различию в специфической последовательности ДНК). Кроме того, индуцированные генетические повреждения отличаются различной репарацией ДНК. Батарея тестов ICH разработана для расширения возможностей обнаружения генотоксикантов. Несмотря на то что методы исследования генотоксичности in vitro могут быть признаны чрезмерно чувствительными, их используют для обнаружения большинства генотоксичных канцерогенов грызунов. Сравнения "оценочных листов" исследования генотоксичности с исследованием канцерогенности веществ для грызунов показали наличие нескольких "ложноположительных" результатов (то есть обнаружение агентов, не являющихся канцерогенами грызунов). Тем не менее неясно, является ли исследование канцерогенности на грызунах более надежным методом, чем оценка непосредственно генотоксичности.
Недавние работы определили два новых класса лекарственных средств, вызывающих повреждение ДНК путем взаимодействия с топоизомеразами. Они приводят к значительному количеству ложноположительных результатов in vitro (см. [29]). В последующих работах представлена гораздо более низкая процентная доля необъяснимых положительных результатов in vitro относительно лекарственных средств (см. [16]). Вся информация, подтверждающая возможность на основе оценки генотоксичности прогнозировать канцерогенность и мутагенность половых клеток, получена в результате анализа промышленно выпускаемых химических веществ и лекарственных средств. Исследование медицинских изделий, как правило, включает применение экстрактов, которые часто содержат сложные смеси химических веществ. В настоящее время на экстрактах из изделий, содержащих неизвестные на данный момент вещества, получено небольшое количество положительных результатов.