Вследствие воздействия пыли и распыляемых аэрозолей может происходить случайная контаминация ДНК, поэтому организация рабочих мест в лаборатории основывается на строгом соблюдении:
- последовательности всех установленных методологических этапов, используемых для получения промежуточных и конечных результатов;
- принципа "прямого потока" при обращении с пробами.
Использование последнего принципа гарантирует, что ДНК, подлежащая анализу, и амплифицированная ДНК, полученная в результате ПЦР, остаются физически разделенными.
Дополнительные требования к лабораториям приведены в ISO 24276.