Методика основана на определении МЦПА с помощью капиллярной газожидкостной хроматографии (ГЖХ) с электронно-захватным детектором (ЭЗД) после экстракции из анализируемых проб семян и масла льна смесью ацетонитрил-вода-соляная кислота, очистки экстрактов перераспределением в системе несмешивающихся растворителей. Газохроматографическому измерению предшествует стадия дериватизации вещества в бутиловый эфир.
Количественное определение проводится методом абсолютной калибровки.