Микробиологическую чистоту определяют в лекарственных средствах, содержащих живые микроорганизмы, путем высева на элективные питательные среды, культуры клеток (для вирусных вакцин) или с использованием тест-систем, предназначенных для обнаружения ДНК посторонних бактерий, вирусов и микоплазм.