При эпизоотологическом обследовании природных очагов различных трансмиссивных болезней основными разделами энтомологической работы являются массовый сбор кровососущих членистоногих для лабораторного исследования и проведение учетов численности переносчиков. Учеты численности осуществляются как в процессе планового обследования территории очага одновременно со сбором эктопаразитов для лабораторного исследования (разовые учеты), так и на стационарных участках. Разовые учеты численности дают оперативную информацию о видовом составе и состоянии численности переносчиков на конкретном участке энзоотичной территории в определенный момент времени. Исчерпывающую информацию о состоянии численности переносчиков на протяжении года, определяющих ее факторах, получают на эпизоотологических стационарах. При этом учеты численности эктопаразитов осуществляют регулярно: в оптимальные фенологические сроки на протяжении сезона их активности или круглогодично (ежемесячно или ежедекадно). На стационарах проводят также углубленное изучение вопросов экологии, эпизоотологии носителей и переносчиков по специальным комплексным программам. Собранный полевой материал передается на лабораторное исследование. Обе эти формы учетов численности и распределения эктопаразитов не исключают, а дополняют друг друга. Во многих случаях их четкое разграничение повышает информацию об уровне и динамике численности популяций переносчиков. Специальные учетные работы организуют на территориях, где проводят дезинсекцию или дезакаризацию.
Эктопаразитов в процессе обследования природных очагов собирают с мелких млекопитающих, птиц, из их гнезд и входов нор, с крупных домашних и диких млекопитающих, отлавливают в природных биотопах и в жилье человека. Осмотру на наличие эктопаразитов подлежат все найденные трупы млекопитающих и птиц. В случае добычи редких для обследуемой территории видов животных или их гнезд, сборы паразитических членистоногих с этого материала фиксируются и хранятся в коллекции учреждения.
При эпизоотологическом обследовании очагов чумы основное внимание как переносчикам уделяют блохам, которых собирают из основных мест их обитания - шерсти хозяина, его гнезд и входов нор. При этом в различных очагах в зависимости от особенностей экологии носителей и переносчиков возбудителя чумы обследуют преимущественно те места обитания, массовый сбор эктопаразитов из которых более доступен, а их лабораторное исследование - наиболее информативно. В большинстве очагов основные сборы проводят со зверьков. В поселениях малого, горного и длиннохвостого сусликов организуют массовые сборы мигрирующих блох из входов нор. В поселениях малых песчанок, где в первом отрезке нор численность блох низкая, их выбирают из более глубоких отрезков. Доступным является массовый сбор блох из гнезд полевок. Наряду с блохами, из различных местообитаний собирают и других, попутно встречающихся, кровососущих членистоногих, в первую очередь иксодовых клещей, при необходимости - гамазовых клещей, вшей. В последнем случае при очень высокой численности членистоногих допускается их выборочный сбор (по 10-20 экз. с объекта) для лабораторного исследования.
При эпизоотологическом обследовании очагов туляремии, клещевого вирусного энцефалита, клещевых боррелиозов, клещевого риккетсиоза, геморрагических лихорадок (Крымская, Омская) основное внимание уделяют сбору иксодовых клещей в природных биотопах и (или) с сельскохозяйственных животных, а также с мелких млекопитающих (грызунов), птиц, по возможности - с крупных диких животных. Сбор прочих кровососущих членистоногих (комаров, мошек, мокрецов, слепней, а также аргасовых, гамазовых и краснотелковых клещей, вшей) проводят, исходя из конкретных особенностей природного очага и задач противоэпидемических формирований. Эта работа обычно осуществляется на эпизоотологических стационарах.
В очагах арбовирусных инфекций (лихорадки Западного Нила, денге, Синдбис, Карельской, японского энцефалита и др.) обязательным является отлов комаров. В очагах сибирской язвы и туляремии осуществляют сбор слепней.
Для того, чтобы собранный в ходе эпизоотологического обследования полевой материал использовать как учетный, необходимо соблюдать ряд требований. Методы сбора эктопаразитов в местах их обитания должны быть однотипными. Необходимо иметь данные о числе осмотренных объектов и объектов, где встречаются те или иные эктопаразиты. Добытых животных помещать в мешочки по одному или, в редких случаях - по несколько экземпляров одного вида с учетом места добычи, биотопа и т.д. Не перегружать пробирки при сборе в них членистоногих. По возможности проводить определение видовой принадлежности эктопаразитов. В отдельных случаях видовой состав эктопаразитов можно установить, используя консервированный материал. Для этого часть сборов эктопаразитов из различных мест обитания консервируют в 70%-м спирте (с учетом количества осмотренных объектов). Комаров целесообразно сохранять сухими на ватных матрасиках или уложенными в широкогорлую пробирку между тонкими слоями ваты. При обследовании малоизученной территории необходимо определять до вида всех кровососущих членистоногих.
Упаковку и доставку полевого материала в лабораторию проводят согласно требованиям действующих санитарно-эпидемиологических правил по безопасности работы с ПБА I-IV групп патогенности (опасности). Собранных в природных биотопах кровососущих членистоногих доставляют в лабораторию живыми или прижизненно замороженными. В летнее время живых членистоногих можно транспортировать в специальном автономном холодильнике, работающем от бортовой сети автомобиля, термоизолирующих контейнерах с хладагентами.
К полевому материалу прилагают сопроводительную этикетку. В ней указывают: подробно - адрес "точки" сбора материала (административная принадлежность, ландшафтный район, урочище, расстояние и направление от ориентира, координаты), биотоп, вид материала, его количество, метод сбора (учета), число использованных орудий лова (или число единиц учета), количество обследованных объектов (из них - с паразитами), дату, фамилию сборщика.
Координаты "точки" обследования определяют с помощью ГЛОНАСС/GPS-приемников (спутниковых навигаторов) в системе глобального позиционирования. Приемник осуществляет радиосвязь с несколькими спутниками и определяет геодезические координаты широты и долготы своего местоположения в угловых градусах и минутах. Эти значения записывают на этикетке с максимальной точностью, выдаваемой приемником. Следует помнить, что точность определения координат абсолютным (автономным) способом (однократная засечка одним приемником без базовой станции) колеблется от 10 до 50 м, поэтому измеряют координаты приблизительно центральной точки на участке, где осуществляют сбор материала. Данные о географическом положении "точки" (расстояние и направление до ближайшего населенного пункта, урочище и др.) нужны для общей ориентации при обработке материала. Для удобства использования полученной на каждой "точке" информации (особенно при работе в GPS) их нумеруют по разработанной заранее системе.