Отбор проб производят в соответствии с ГОСТ 17.1.5.05, ГОСТ 17.1.3.08 и ГОСТ Р 51592. Оборудование для отбора проб должно соответствовать ГОСТ 17.1.5.04 и ГОСТ Р 51592.
Пробу отбирают в стеклянную посуду после двухкратного ополаскивания морской водой склянки и пробки. Объем пробы 150-200 см. Анализ проб должен производиться не позднее шести часов после отбора. Если анализ не может быть осуществлен в течение этого времени, пробу консервируют, добавляя 1 см хлороформа на 200 см воды, и хранят при температуре 3-5°С не более 2-3 дней. Хранение пробы до 10 дней возможно при замораживании в полиэтиленовой посуде до минус 18°С.
При определении растворенных форм фосфатов пробы следует профильтровать не позже, чем через 4 ч после отбора в соответствии с приложением А.