Оценку влияния наноматериалов на нормальную микрофлору кишечника в условиях in vivo проводят на основании изучения видового состава и количественных уровней основных микробных популяций микробиоценоза кишечника, их функциональной активности путем посевов фекальных масс или содержимого толстого кишечника лабораторных животных, которым внутрижелудочно вводят образцы наноматериалов, при сравнении с животными, которым вводят традиционный аналог наноматериала, и с контрольными животными. В качестве групп сравнения (контроль) используют животных, которым вводят дистиллированную воду или среду - носитель наноматериала.
Проводят изучение не менее 4 групп и родов защитных популяций микрофлоры (лактобактерии, бифидобактерии, бактероиды, лактозоферментирующие энтеробактерии) и 5 групп и родов транзиторных (условно-патогенных) представителей микробиоты (энтеробактерии, стафилококки, энтерококки, дрожжевые и дрожжеподобные грибы, споровые анаэробы и др.) на соответствующих дифференциально-диагностических и селективных средах.
Количественный учет бифидобактерии проводят на тиогликолевой среде или среде Блаурокка; лактобацилл - на среде МРС; энтеробактерий - на среде Эндо и цитратном агаре. Содержание стафилококков определяют на желточно-солевом агаре и среде Байрд-Паркера; стрептококков - на кровяном агаре; энтерококков - на среде МИС; количество сульфитредуцирующих клостридий - на железосульфитной среде; дрожжей - на среде Сабуро; плесневых грибов - на среде Сабуро или Чапека.
У штаммов энтеробактерий, стафилококков проводят определение таксономической принадлежности до уровня вида с использованием системы мультимикротестов API для биохимической идентификации, производства фирмы "Bio Merieux" (Api 10S, Api 20E, Api RapiD 20E, Api Staph), и/или классических методов исследования.
Содержание определенных групп, родов, видов микроорганизмов (плотность популяций) выражают в десятичном логарифме числа колониеобразующих единиц на 1 г сырой массы фекалий или кишечного содержимого (lg KOE/г).
Помимо количественных характеристик определяют наличие факторов патогенности, таких как гемолитическая активность энтеробактерий, стафилококков, энтерококков, лецитиназная и коагулазная активность стафилококков, способность к образованию хламидоспор и псевдомицелия дрожжеподобными грибами.
Определение функциональных свойств (антагонистической активности) популяций бифидобактерий, выделенных из кишечника лабораторных животных, проводят по степени их кислотообразующей активности в среде культивирования.
Полученные значения подвергают статистической обработке с помощью критерия Стьюдента и непараметрического рангового критерия Мана-Уитни. Различие между опытной и контрольными группами признаются достоверными на уровне значимости Р<0,05. Расчеты проводят с помощью пакетов программ EXCEL и SPSS.