Исследуемый материал (фекалии мышей или навеску из содержимого слепой кишки крыс) в пределах 1 г (взвешивают на электронных весах на стерильной подложке) вносят в предварительно регенерированный агаризованный (0,1%) тиогликолево-фосфатный буфер, обеспечивающий выживание анаэробных микроорганизмов, в соотношении 1 к 10. Из этой суспензии готовят последовательные десятикратные разведения на фосфатно-тиогликолевом буфере от 10 до 10. Каждое разведение, начиная с исходного, гомогенизируют методом, имитирующим центрифугирование (круговыми движениями руки при согнутом локтевом суставе).
Подготовленные разведения используют для посева на дифференциально-диагностические и селективные среды для количественного учета девяти групп микроорганизмов - представителей защитной микрофлоры и представителей транзиторной (сопутствующей) микрофлоры.