По окончании введения тестируемых наноматериалов животных подвергают эвтаназии одним из разрешённых для этого способов (приказ МЗ СССР N 755).
Мышей после усыпления эфиром подвергают вскрытию и проводят отбор фекальных масс из содержимого их толстого кишечника в стерильную одноразовую посуду.
Крыс после усыпления эфиром подвергают вскрытию, в процессе вскрытия выделяют слепую кишку, помещают в стерильную одноразовую посуду и в условиях асептики отбирают её содержимое в бакпечатку для исследования микрофлоры.
Образцы хранят не более 3 ч при (4±2) °С.