Определению не мешают гербициды ряда карбоновых и феноксиуксусных кислот (далапон, 2М-4Х, трихлорацетат натрия).
При использовании неполярной фазы SE-30 время удерживания этилового эфира 2,4-Д совпадает со временем удерживания -ГХЦГ, однако в процессе экстракции гербицидов и последующей очистки экстрактов изомеры ГХЦГ не переходят в эфирный экстракт и не мешают определению 2,4-Д. Время удерживания бутилового эфира 2,4-Д совпадает со временем удерживания 2,4'-ДДЭ, однако также в процессе экстракции и очистки экстрактов 2,4'-ДДЭ не переходит в эфирный экстракт, поэтому не мешает определению 2,4-Д.
Анализ 2,4-Д в виде двух различных эфиров - этилового и бутилового - обусловлен тем, что среди природных соединений почвы, воды и других объектов встречаются соединения, имеющие время удерживания, совпадающее со временем удерживания одного из этих эфиров.