Методы биотестирования донных отложений имеют ряд общих принципов с методами биотестирования природных вод, но имеют и свою специфику:
а) в зависимости от поставленных задач и имеющихся в наличии тест-объектов биотестирование проводят:
- на нативной пробе донных отложений, для анализа такой пробы желательно использовать в качестве тест-объектов представителей бентоса, т.е. организмы, для которых естественной средой обитания являются донные отложения (например, хирономиды, моллюски);
- на водной вытяжке (экстракте) донных отложений, для анализа такой пробы можно использовать любые тест-объекты;
б) использование в контрольной серии донных отложений с фонового участка, имеющих идентичный тип грунта (ил, песок), гранулометрический состав и, желательно, уровень органического загрязнения;
в) получение вытяжек донных отложений в зависимости от их типа (песок, ил, ракушечник) имеет особенности.