Контроль за реализацией краевых целевых программ осуществляет администрация края. Участники реализации программы ежеквартально представляют государственным заказчикам, а те - в Главное управление экономики администрации края информацию о ходе реализации программы, в Главное финансовое управление администрации края - отчет об использовании бюджетных средств на программные мероприятия.
Администрация края ежеквартально представляет информацию в Законодательное Собрание края о реализации всех краевых целевых программ.