Общее руководство и контроль за ходом реализации программы осуществляется государственными заказчиками программы - главными распорядителями средств областного бюджета.
Координатором программы является министерство экономического развития, промышленности и транспорта области, которое взаимодействует с Министерством регионального развития Российской Федерации, Министерством экономического развития Российской Федерации и другими федеральными органами исполнительной власти и по итогам каждого года информирует губернатора области о ходе выполнения программных мероприятий.
Государственные заказчики программы, органы местного самоуправления заключают с исполнителями программных мероприятий договоры (контракты) и проводят организационную работу по их выполнению в соответствии с документацией, регламентирующей порядок реализации программы.
Исполнители несут ответственность за выполнение программных мероприятий.
Государственные заказчики готовят:
проекты нормативных правовых актов Амурской области по проблемам осуществления программы;
решения по отбору проектов и мероприятий для реализации в рамках программы;
предложения, связанные с корректировкой целевых показателей, сроков, исполнителей и объемов ресурсов по программе.
Государственным заказчикам предоставлено право по данным систематического контроля и с учетом выделенных на реализацию программных мероприятий финансовых средств ежегодно готовить предложения с уточнением целевых показателей, состава исполнителей и затрат по программным мероприятиям, поскольку недофинансирование и несвоевременное ресурсное обеспечение мероприятий могут привести к общей задержке достижения целей и этапов решения основных программных задач. Государственные заказчики, основываясь на данных контроля, могут обратиться с предложением о продлении срока действия программы в целом.
Министерство экономического развития, промышленности и транспорта области:
осуществляет координацию и взаимодействие всех заинтересованных органов исполнительной власти области по выполнению мероприятий программы;
обеспечивает направление бюджетных заявок области в Министерство экономического развития Российской Федерации и Министерство регионального развития Российской Федерации.
Контроль и анализ выполнения программы осуществляются по всему комплексу программных мероприятий независимо от источников финансирования.