Контроль за исполнением Программы осуществляют Управление по работе с административными, правоохранительными органами и невоенизированными формированиями Администрации городского округа Самара.
Главные распорядители и получатели средств несут ответственность за качественное и своевременное выполнение мероприятий Программы, рациональное использование выделяемых на их реализацию финансовых средств. Отчеты о выполнении мероприятий Программы представляются получателями и ответственными исполнителями Программы в Администрацию городского округа Самара ежегодно не позднее 15 января.
Контроль за исполнением Программы осуществляет Дума городского округа Самара посредством рассмотрения отчетов об исполнении Программы в соответствии с Положением "О порядке представления и рассмотрения отчетов об исполнении целевых программ городского округа Самара Думой городского округа Самара".
Контроль за целевым использованием выделенных бюджетных средств осуществляет Департамент финансов Администрации городского округа Самара, руководитель аппарата Администрации городского округа Самара.