Контроль за ходом реализации Подпрограммы осуществляет Правительство Нижегородской области.
Правительство Нижегородской области:
координирует работу исполнителей подпрограммных мероприятий;
проводит согласование объемов финансирования на очередной финансовый год и на весь период реализации Подпрограммы;
обеспечивает контроль за реализацией Подпрограммы, включающий в себя контроль за эффективным и целевым использованием финансовых средств, контроль за качеством проводимых мероприятий и за выполнением сроков реализации.
Выполнение оперативных функций по реализации Подпрограммы осуществляет минсельхозпрод, который определяет формы и методы управления реализацией Подпрограммы, обеспечивает в пределах компетенции и в соответствии с законодательством проведение необходимых конкурсных процедур по выбору участников Подпрограммы, осуществляет проверки хода выполнения Подпрограммы и ежегодно в установленном порядке представляет в Правительство Нижегородской области сводные отчеты о результатах выполнения Подпрограммы. Минсельхозпрод несет ответственность за реализацию и конечные результаты Подпрограммы, за рациональное использование выделяемых финансовых средств.