Организация оказывает услуги по сопровождению бурения (Подрядчик). При выполнении работ организация использует собственное оборудование. В связи с этим в договоре отдельно прописаны случаи и порядок возмещения ущерба В результате работы, по вине Заказчика, оборудование было оставлено в скважине. Организация понесла ущерб. Организация является плательщиком НДС. Организация  отдельно выставляет счет-фактуру для оплаты возмещения ущерба с учетом НДС. Заказчик не согласен оплачивать НДС.