3.1. Заповедник учрежден постановлением Совета Министров РСФСР N 409 от 25 июля 1991 года, по решению Совета народных депутатов Горно-Алтайской автономной области N 127 от 18 апреля 1991 года. По решению 22-й сессии Комитета Всемирного Наследия ЮНЕСКО, проходившей в Киото 27 ноября - 3 декабря 1998 года, заповедник "Катунский" вместе с другими территориями был внесен в Список Всемирного Природного и Культурного Наследия. Заповедник учрежден на территории общей площадью 151637 га.
3.2. На прилегающих к территории заповедника участках земли Решением Исполнительного комитета Совета народных депутатов Горно-Алтайской автономной области от 18.04.91 N 127 "О создании Катунского государственного заповедника" создана охранная зона с ограниченным режимом природопользования.
3.3. Заповедник имеет статус государственного природного биосферного заповедника на основании решения Президиума Международного координационного Совета программы ЮНЕСКО "Человек и биосфера" от 21 января 2000 года, принятого по поручению Совета программы. Этот статус подтверждается Сертификатом, подписанным Генеральным директором ЮНЕСКО 21 января 2000 года.
3.4. К территории заповедника в соответствии со статьей 10 Федерального закона "Об особо охраняемых природных территориях" в целях проведения научных исследований, экологического мониторинга, а также апробирования и внедрения методов рационального природопользования, не разрушающих природную среду и не истощающих биологические ресурсы, может быть присоединена территория биосферного полигона (территория сотрудничества) с дифференцированным режимом особой охраны и функционирования.