3. Организация и осуществление деятельности подразделений Службы, контроль за исполнением возложенных на них задач.
4. Организация и осуществление силового обеспечения при проведении уполномоченными подразделениями таможенных органов специальных операций и специальных мероприятий по пресечению контрабанды и иных преступлений и правонарушений в сфере таможенного дела.
5. Применение СОБРов и подразделений таможенной охраны для физической защиты сотрудников таможенных органов при выполнении ими служебных обязанностей, а также предотвращение посягательств на жизнь, здоровье и имущество сотрудников таможенных органов и их близких с целью воспрепятствовать законной деятельности указанных сотрудников или принудить их к изменению ее характера, либо из мести за указанную деятельность.
6. Организация деятельности подразделений таможенной охраны и охрана объектов таможенной инфраструктуры, обеспечение безопасной работы таможенных органов региона.
7. Организация и осуществление деятельности оперативно-дежурной службы с целью непрерывного сбора, обобщения и анализа данных оперативной обстановки в регионе. Передача распоряжений руководства таможенных органов и контроль за их выполнением, подготовка данных для принятия решений при возникновении чрезвычайных ситуаций.
8. Организация и осуществление деятельности морских и авиационных подразделений в целях эффективного применения морских (речных) и воздушных судов таможенных органов региона.
9. Организация и осуществление оборота оружия и боеприпасов в системе таможенных органов РТУ, решение отдельных вопросов оборота спецсредств.
10. Организация, осуществление и контроль боевой и специальной подготовки подразделений Службы, а также подготовки других сотрудников таможенных органов региона к действиям в условиях, связанных с применением огнестрельного оружия и специальных средств.
11. Разработка программ по оснащению подразделений Службы оружием, специальными средствами, автотранспортом, морскими (речными) и воздушными судами, а объектов таможенной инфраструктуры техническими средствами охраны (далее - ТСО) и осуществление этих программ.